Nasib Persegi Gianyar untuk mengikuti kompetisi Divisi Utama Liga Indonesia 2006 masih menjadi tanda tanya. Di saat tim-tim lain sedang melakukan ujicoba ataupun bongkar pasang pemain, tim ini masih berkutat dengan permasalahan internal mereka, yaitu permasalahan dana. Mundur dari kompetisi sempat santer dikumandangkan oleh pengurus tim berjuluk Laskar Kuda Jingkrak ini.

Meskipun begitu, PSSI sebagai otoritas tertinggi persepakbolaan di Indonesia masih memberikan kesempatan kepada Persegi untuk eksis. PSSI dan Badan Liga Indonesia (BLI) sebagai pelaksana kompetisi Divisi Utama dan Divis I Liga Indonesia memang pernah memberikan peringatan berupa batas waktu hingga 31 Desember untuk mendaftarkan diri.

Namun, keistimewaan diberikan kepada Persegi Gianyar. Sebagai keringanan atas permintaan pengurus baru Persegi, tenggat waktu itu diperpanjang hingga 7 Januari mendatang. Menurut keterangan Manajer Kompetisi Djoko Driyono, baru-baru ini, tenggat waktu yang diberikan oleh PSSI dan BLI tersebut hanya bersifat imbauan dan bukan pemaksaan. PSSI sendiri masih berharap Persegi dapat mengikuti kompetisi Divisi Utama tahun 2006 ini.

Menurut Djoko Driyono, untuk kasus Persegi ini nantinya hanya ada dua kemungkinan, yakni mundur dari kompetisi atau mogok. Persegi bisa dibilang mundur dari kompetisi jika memberikan konfirmasinya sebelum kompetisi resmi dimulai. Mereka akan dikatakan mogok bila hingga saat kick-off tim kebanggaan masyarakat Gianyar itu tidak tampil tanpa memberikan alasan apa pun sebelumnya.