Akhirnya pertandingan babak kedua Copa Indonesia antara PSIS Semarang yang bakal meladeni tim sesama Divisi Utama Persija Jakarta diundur untuk memberi kesempatan kepada dua klub tersebut untuk menjalani babak delapan besar kompetisi Liga Indonesia 2006 yang bakal berlangsung 17-23 Juli ini.

Asisten Manajer Tim PSIS, Setyo Agung Nugroho, yang menanyakan perihal jadwal babak kedua Copa kepada PSSI yang bakal menggelar pada 3 Juli dan 8 Juli akhirnya dijawab oleh pihak PSSI bahwa terlah terjadi salah jadwal dan diganti menjadi 3 Agustus 2006 (pertandingan pertama di Semarang) dan 8 Agustus 2006 (untuk pertandingan kedua di Jakarta).

Dia menambahkan, dengan adanya keputusan seperti itu maka program latihan untuk menghadapi babak delapan besar Kompetisi Liga Indonesia 2006 di Stadion Manahan Solo, 18-23 Juli 2006 tidak berubah atau sesuai dengan jadwal. Mulai Selasa (4/7) besok, Maman Abdurahman dkk. bakal menjalani latihan di Solo hingga menjelang digulirkannya babak 8 besar.

Babak delapan besar wilayah barat di Stadion Manahan Solo diikuti oleh Arema Malang, Persik Kota Kediri, PSIS Semarang, dan Persiba Balikpapan. Pada hari pertama atau tanggal 18 Juli 2006, PSIS Semarang bermain melawan Arema Malang, kemudian tanggal 20 Juli melawan Persik Kota Kediri, dan tanggal 23 Juli melawan Persib Balikpapan.

Dua tim teratas masing-masing grup berhak maju ke babak semi final yang dijadwalkan berlangsung di Stadion Manahan Solo tanggal 28 Juli 2006, sedangkan babak final dimainkan di tempat yang sama tanggal 30 Juli 2006.